通過細(xì)胞注釋共獲得八種細(xì)胞類型，包括B細(xì)胞，CD4T細(xì)胞，CD8T細(xì)胞，巨核細(xì)胞，單核細(xì)胞衍生的樹突狀細(xì)胞，中性粒細(xì)胞，NK細(xì)胞和未分化T細(xì)胞，e-f表明MPXV感染會(huì)導(dǎo)致全面的免疫細(xì)胞改變，HIV患者在急性期表現(xiàn)出CD4缺陷，隨后在恢復(fù)期出現(xiàn)NK細(xì)胞和中性粒細(xì)胞失調(diào)。

作者根據(jù)典型標(biāo)記基因表達(dá)確定了五個(gè)簇（F2a），并評(píng)估了與活化相關(guān)的基因的表達(dá)，CD79A主要富集在亞簇1、3和5中，而MZB1和XBP1主要在亞簇2和4中表達(dá)（F2b），表明它們可能代表用于抗體產(chǎn)生的漿細(xì)胞。同時(shí)，所有亞簇均未表達(dá)CD79B，這導(dǎo)致BCR組織功能障礙，從而影響B(tài)細(xì)胞功能。漿細(xì)胞亞簇2和4的比例在患者急性期的比例明顯高于恢復(fù)期（F2c）。細(xì)胞增殖標(biāo)志物MKI67的表達(dá)主要在亞簇2和4中富集，而在亞簇1、3和5中幾乎不存在，表明急性期抗體分泌細(xì)胞增殖（F2d）。為了探索MPXV感染時(shí)的分子擾動(dòng)，對(duì)MPXV感染急性期和恢復(fù)期的患者進(jìn)行了B細(xì)胞（包括漿細(xì)胞）的差異基因表達(dá)分析，CD38和CD27在非HIV患者中上調(diào)更明顯（F2e），這表明HIV感染可能會(huì)限制MPXV感染后的細(xì)胞功能和分化。

作者根據(jù)典型標(biāo)志基因表達(dá)確定了9個(gè)CD8+T細(xì)胞亞群，觀察發(fā)現(xiàn)在大多數(shù)亞群中T細(xì)胞有效標(biāo)志物的低表達(dá)，表明所有患者的CD8+T細(xì)胞均存在持續(xù)的T細(xì)胞功能障礙。

根據(jù)標(biāo)記基因?qū)K細(xì)胞分為9個(gè)不同的亞群。分析表明，NK細(xì)胞通過表達(dá)細(xì)胞毒性分子發(fā)揮抗MPXV的作用。然而，HIV陽性患者的NK細(xì)胞比例下降，這可能會(huì)阻礙他們從MPXV感染中恢復(fù)。

根據(jù)單核細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞亞群的特征，作者確定了三個(gè)不同的亞群。分析結(jié)果表明，mono/DC在抗MPXV功能期間被激活，而HIV改變了MPXV感染中的mono/DC動(dòng)態(tài)，這可能會(huì)抑制抗MPXV免疫。

作者從包含8個(gè)中性粒細(xì)胞亞簇的整個(gè)UMAP空間中提取了中性粒細(xì)胞（F6a）。幾種中性粒細(xì)胞發(fā)育標(biāo)志物的可視化表明樣本中中性粒細(xì)胞的發(fā)育階段高度異質(zhì)性（F6b）。具體而言，中性粒細(xì)胞成熟的兩個(gè)標(biāo)志物FCGR3A和SELL在MPXV感染急性期表現(xiàn)出明顯更高的mRNA水平，說明MPXV誘導(dǎo)的中性粒細(xì)胞成熟加速，這可能與病毒消除有關(guān)。粒細(xì)胞分化和ISG表達(dá)在HIV+患者中可以受到抑制。

根據(jù)細(xì)胞間的通訊作用推測(cè)LGALS9可能是限制MPXV消除后T細(xì)胞抗病毒應(yīng)答的關(guān)鍵因素。此外，每種細(xì)胞類型的傳出和傳入相互作用概況分析也支持在急性期存在更強(qiáng)的相互作用（F7d）。單核細(xì)胞/樹突狀細(xì)胞(DC)和中性粒細(xì)胞介導(dǎo)的相互作用在急性期和恢復(fù)期均最強(qiáng)，在細(xì)胞相互作用的傳入和傳出信號(hào)方面，急性期和恢復(fù)期樣本之間幾乎沒有差異（F7e-f）。簡(jiǎn)而言之，半乳糖凝集素、膜聯(lián)蛋白、IL16和CCL是負(fù)責(zé)細(xì)胞相互作用的前四種分子（F7e-f）。這表明先天免疫細(xì)胞對(duì)于MPXV的消除至關(guān)重要，本研究的研究結(jié)果有助于確定潛在的靶向細(xì)胞相互作用，從而改善病毒的消除。