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帕金森病患者胃癌風險更低?50萬人研究提供遺傳學證據(jù)

發(fā)布時間:  2025-04-24 14:32:25


2025年4月16日,《BMC Neurol》刊登了一項中國學者的孟德爾隨機化(MR)研究論文,探討了帕金森病(PD)與胃癌的因果關系。該研究通過雙樣本和兩步MR方法,利用遺傳變異作為工具變量,排除了傳統(tǒng)觀察性研究中的混雜偏倚,得出了一系列重要發(fā)現(xiàn)。




摘要


背景

PD與胃癌等年齡相關疾病對全球老齡化人群構成了顯著負擔。既往觀察性研究提示PD可能與胃癌存在相關性,然而研究結果尚不一致。本研究基于全基因組關聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù),運用MR方法探討PD與胃癌之間的潛在因果關系。

方法

本研究采用雙樣本MR分析,利用GWAS數(shù)據(jù)庫中共計482,730例PD患者及476,116例胃癌患者的數(shù)據(jù)。以逆方差加權法(IVW)作為主要分析方法,同時開展敏感性分析評估異質(zhì)性與多效性,并進一步進行兩步MR分析,以明確PD與胃癌之間因果關系的潛在中介因素。

結果

結果顯示,PD與胃癌之間存在負向因果關聯(lián)。異質(zhì)性與多效性分析支持IVW結果的穩(wěn)健性。此外,P2X6被識別為介導該負向因果關系的關鍵中介因子。

結論

PD患者可能具有較低的胃癌發(fā)生風險,而P2X6可能在其中發(fā)揮重要中介作用。本研究所揭示的新機制為PD及胃癌的潛在治療靶點開發(fā)提供了新的理論依據(jù)。




結果


MR分析揭示PD對胃癌的負向因果效應

我們發(fā)現(xiàn)PD與胃癌之間存在顯著的負向因果關系。在雙樣本MR分析中,以PD為暴露變量、胃癌為結局變量,并以SNP為工具變量,IVW結果顯示PD可能降低胃癌的發(fā)病風險。

在完整的MR分析中,Cochran’s Q檢驗結果提示該分析不存在異質(zhì)性。Leave-one-out敏感性分析顯示,未發(fā)現(xiàn)任何單一SNP對PD與胃癌因果效應的估計產(chǎn)生顯著干擾,進一步確認結果的穩(wěn)健性。此外,水平多效性分析未顯示明顯多效性證據(jù)(P = 0.715)。

當以胃癌為暴露、PD為結局變量進行反向MR分析時,未觀察到胃癌對PD風險的潛在因果效應。

PD與胃癌之間因果路徑的中介變量識別

為進一步探索PD對胃癌影響的潛在機制,我們開展了兩步孟德爾隨機化分析。采用IVW方法,結果顯示P2X6可能為PD與胃癌之間關聯(lián)的重要中介變量。具體而言,我們發(fā)現(xiàn)PD對P2X6具有正向因果效應,而P2X6對胃癌則表現(xiàn)出負向因果效應。




研究方法


雙樣本MR分析

本研究采用雙樣本MR方法,以探究PD與胃癌之間的潛在因果關系。分析分為兩個階段:第一階段將PD作為暴露變量,胃癌為結局變量;第二階段則將胃癌作為暴露變量,PD為結局變量(見圖1)。SNP被用作工具變量。雙樣本MR分析基于以下三個核心假設:(I)工具變量與暴露(PD/胃癌)顯著相關;(II)工具變量僅通過暴露變量對結局變量(胃癌/PD)產(chǎn)生影響;(III)工具變量與混雜因素無關。


暴露與結局的匯總水平數(shù)據(jù)均來自GWAS數(shù)據(jù)庫,樣本均為歐洲人群。PD的GWAS數(shù)據(jù)(編號:ieu-b-7)包含33,674名PD患者與449,056名對照者,共納入17,891,936個SNP,用于暴露變量的遺傳關聯(lián)統(tǒng)計。胃癌的GWAS數(shù)據(jù)(編號:ebi-a-GCST90018849)包含1,029名胃癌患者與475,087名對照者,共納入24,188,662個SNP,用于結局變量的遺傳關聯(lián)統(tǒng)計。

在MR分析中,我們使用與暴露變量相關的遺傳變異作為工具變量,推斷暴露與結局之間的潛在因果關系。主要分析方法為乘法隨機效應模型下的IVW,并輔以MR-Egger回歸、加權中位數(shù)法、簡單模式法與加權模式法。若五種方法中至少一種分析的P值?<?0.05,即認為存在統(tǒng)計學顯著的因果關聯(lián)。PD相關遺傳變異篩選標準為:GWAS中P值?<?5?×?10??(常用于降低假陽性率并確保關聯(lián)穩(wěn)?。M足以下條件:位于10,000 kb范圍內(nèi)、低連鎖不平衡(r2?<?0.001)、工具變量強度充足(F統(tǒng)計量?>?10)。

兩步孟德爾隨機化分析

為進一步識別可能介導PD與胃癌之間因果關系的候選蛋白(中介變量),本研究開展了兩步MR分析。蛋白質(zhì)相關GWAS數(shù)據(jù)來源于GWAS數(shù)據(jù)庫(編號:prot-a-2160)。兩步MR分析中,暴露對結局的直接效應計算公式為:β? ? β? × β?。其中,β?表示暴露對結局的總因果效應,β?表示暴露對中介變量的因果效應,β?表示中介變量對結局的因果效應,β? × β?則代表暴露通過中介變量對結局的間接效應。

水平多效性通過MR-Egger回歸的截距項進行評估。所有分析均在R軟件(版本4.2.1)中使用TwoSampleMR包(版本0.5.6)完成。




小結


本研究基于大規(guī)模GWAS數(shù)據(jù),采用雙樣本孟德爾隨機化方法系統(tǒng)評估了帕金森病與胃癌之間的潛在因果關系。通過多種孟德爾隨機化分析方法的互為驗證、異質(zhì)性及多效性分析的穩(wěn)健支持,以及兩步孟德爾隨機化模型對中介機制的探索,本研究不僅加強了結果的可信度,也為后續(xù)機制研究與臨床干預提供了理論依據(jù)。





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